Top 4 des logiciels de facturation électronique conformes à la réforme 2026

La facturation électronique devient obligatoire dès septembre 2026 pour toutes les entreprises assujetties à la TVA. Voici les 4 plateformes agréées à connaître pour être conforme sans y laisser votre budget.

Depuis le 1ᵉʳ septembre 2026, toutes les entreprises assujetties à la TVA doivent pouvoir recevoir des factures électroniques via une Plateforme Agréée (PA) immatriculée par la DGFiP. L'obligation d'émission suit dès 2027 pour les TPE et micro-entreprises.

Pour être conforme, un seul prérequis : choisir une plateforme agréée avant septembre 2026.

En résumé :

• La facturation électronique est obligatoire dès le 1ᵉʳ septembre 2026 pour la réception, et septembre 2027 pour l'émission (TPE/micro-entreprises).
• Seules les Plateformes Agréées (PA) immatriculées par la DGFiP permettent d'être conforme.
• Indy est une PA immatriculée par l'État, gratuite et intégrée à un outil de gestion complet.
• Henrri, Facture.net et Shine sont des alternatives solides selon les besoins.
• Le choix dépend de trois critères : statut PA, fonctionnalités incluses et coût réel.

Comment choisir le meilleur logiciel de facturation électronique ?

Tous les outils de ce comparatif permettent d'émettre et de recevoir des factures électroniques conformes à la réforme. La différence pour trouver le meilleur logiciel de facturation se joue sur quatre critères :

• Le statut PA : immatriculé directement par la DGFiP ou via une PA tierce ? Les deux sont valides, mais une PA en propre réduit les dépendances. Vérifiez toujours sur la liste officielle DGFiP.
• Les fonctionnalités annexes : comptabilité, déclarations fiscales, rapprochement bancaire. Pour un investisseur immobilier (SCI, LMNP), vérifiez que le logiciel couvre aussi ces statuts spécifiques.
• Le coût réel à 12 mois : les offres gratuites ont souvent des modules essentiels en option payante. Simulez le coût complet avant de vous engager.
• La compatibilité des formats : votre logiciel doit générer et recevoir les formats Factur-X, UBL ou CII depuis n'importe quelle PA du marché.

Indy : plateforme agréée DGFiP, gratuite et tout-en-un

Indy est une Plateforme Agréée immatriculée par la DGFiP, ce qui signifie qu'elle assure directement la transmission légale de vos factures électroniques, sans intermédiaire.

C'est un point différenciant important : certaines solutions du marché s'appuient sur une PA tierce, ce qui ajoute une dépendance.

Ce qui est inclus gratuitement avec Indy

La facturation électronique est incluse dans toutes les offres Indy, y compris l'offre gratuite : émission et réception illimitées, format Factur-X généré automatiquement, transmission à l'administration fiscale. Aucun surcoût, aucune limite de volume.

Au-delà de la facturation, Indy propose un outil de gestion complet : comptabilité automatisée, déclarations fiscales, compte pro gratuit. Pour un indépendant ou une petite société, c'est l'ensemble de l'administration qui se centralise au même endroit.

Pour qui ?

Les micro-entrepreneurs, freelances, auto-entrepreneurs et petites sociétés (SASU, EURL), mais aussi les investisseurs immobiliers : Indy couvre également la comptabilité des SCI et des LMNP, ce qui en fait une solution rare sur le marché à adresser à la fois les indépendants et les propriétaires bailleurs.

Henrri : simple et gratuit, via Pennylane

Henrri est un logiciel de facturation apprécié pour sa prise en main rapide. L'interface est claire, l'outil est gratuit dans sa version de base et couvre l'essentiel : devis, factures, avoirs.

Le fonctionnement pour la facturation électronique

Henrri n'est pas lui-même une PA immatriculée. Il s'appuie sur Pennylane comme plateforme agréée partenaire pour assurer la transmission conforme des factures. La création d'e-factures reste gratuite et illimitée depuis l'interface Henrri, mais la chaîne de transmission dépend d'un tiers.

Les abonnements payants donnent accès à des fonctionnalités de pré-comptabilité : suivi des paiements, relances, gestion des notes de frais.

Pour qui ?

Les freelances et petites PME qui veulent une solution légère, sans besoin de comptabilité intégrée.

Facture.net : gratuité sans restriction de volume

Bon à savoir : Facture.net est l'un des rares outils à proposer une offre 100 % gratuite sans limite de volume : factures illimitées, clients illimités. L'éditeur s'engage à maintenir cette gratuité après la réforme.

Conformité et fonctionnalités

Pour la transmission électronique, Facture.net s'appuie sur une Plateforme Agréée tierce. L'outil intègre également un CRM basique et des exports multi-formats. Il est conforme à la loi anti-fraude TVA.

En revanche, les fonctionnalités avancées (rapprochement bancaire, relances automatisées) sont absentes ou limitées. C'est un outil de facturation, pas un outil de gestion.

Pour qui ?

Les auto-entrepreneurs et freelances qui émettent un volume élevé de factures et cherchent la solution la plus simple et la plus économique.

Shine : compte pro et facturation dans une seule app

Shine est avant tout un compte professionnel en ligne, adossé à Société Générale depuis 2020, qui intègre des outils de facturation directement dans l'app. L'idée : ne pas jongler entre plusieurs outils pour gérer son activité.

Facturation électronique : le statut en 2026

Shine était en cours d'immatriculation comme Plateforme Agréée au moment de la réforme. La réception de factures électroniques est activable depuis l'espace Shine, avec support des formats Factur-X et UBL. L'outil de facturation est gratuit dans toutes les offres.

Le vrai atout de Shine reste le rapprochement bancaire automatique entre les factures émises et les transactions sur le compte.

Pour qui ?

Les freelances et micro-entrepreneurs qui veulent centraliser compte pro et facturation dans une interface mobile-first.

Tableau comparatif des meilleurs logiciels de facturation électronique

Que vous soyez auto-entrepreneur, freelance ou gérant d'une petite société, le choix se joue sur trois critères : statut de la plateforme agréée, fonctionnalités annexes et coût réel à 12 mois.

Indy se distingue en cumulant immatriculation directe auprès de la DGFiP, facturation électronique gratuite et illimitée, et une gestion complète incluant comptabilité, fiscalité, SCI et LMNP. Henrri, Facture.net et Shine restent de bonnes alternatives selon vos besoins spécifiques.

Dans tous les cas, mieux vaut sécuriser votre choix de plateforme avant septembre 2026 pour aborder la réforme sereinement.